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上位分類群	目名	科名	和名／学名	指定都道府県数	環境省カテゴリ
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	ヨウジウオ Syngnathidae	テングヨウジ Microphis brachyurus brachyurus	5件
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	ヨウジウオ Syngnathidae	ヒメテングヨウジ Microphis jagorii	1件	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	ヨウジウオ Syngnathidae	ヨウジウオ Syngnathus schlegeli	3件
魚類	トビエイ Myliobatiformes	アカエイ Dasyatidae	アリアケアカエイ Dasyatis sp.	1件
魚類	ナマズ Siluriformes	アカザ Amblycipitidae	アカザ Liobagrus reinii	32件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	ナマズ Siluriformes	アカザ Amblycipitidae	アカザ属の一種 Liobagrus sp.	1件
魚類	ナマズ Siluriformes	アカザ Amblycipitidae	アカザ日本海型 Liobagrus sp. Type Japan Sea	1件
魚類	ナマズ Siluriformes	ギギ Bagridae	アリアケギバチ Tachysurus aurantiacus	7件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	ナマズ Siluriformes	ギギ Bagridae	ギギ Tachysurus nudiceps	7件
魚類	ナマズ Siluriformes	ギギ Bagridae	ギバチ Tachysurus tokiensis	11件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	ナマズ Siluriformes	ギギ Bagridae	ネコギギ Tachysurus ichikawai	3件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	ナマズ Siluriformes	ナマズ Siluridae	イワトコナマズ Silurus lithophilus	1件	準絶滅危惧 (NT)
魚類	ナマズ Siluriformes	ナマズ Siluridae	ナマズ Silurus asotus	8件
魚類	ナマズ Siluriformes	ナマズ Siluridae	ビワコオオナマズ Silurus biwaensis	3件
魚類	ニシン Clupeiformes	カタクチイワシ Engraulidae	エツ Coilia nasus	4件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	ニシン Clupeiformes	ニシン Clupeidae	ドロクイ Nematalosa japonica	3件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	ニシン Clupeiformes	ニシン Clupeidae	ニシン Clupea pallasii	1件
魚類	ニシン Clupeiformes	ニシン Clupeidae	ニシン湖沼系群 Clupea pallasii	1件
魚類	ニシン Clupeiformes	ニシン Clupeidae	ヒラ Ilisha elongata	1件
魚類	ニシン Clupeiformes	ニシン Clupeidae	本州の太平洋側湖沼系群のニシン Clupea pallasii	0件	地域個体群 (LP)

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