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| 上位分類群 | 目名 | 科名 | 和名／学名 | 指定都道 府県数 |
環境省カテゴリ |
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| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
フナ属の一種（琉球列島） Carassius sp. |
2件 | 絶滅危惧ⅠA類 (CR) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
フナ（在来個体群） Carassius sp. |
1件 | |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ホンモロコ Gnathopogon caerulescens |
3件 | 絶滅危惧ⅠA類 (CR) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
マルタ Tribolodon brandtii maruta |
6件 | |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ミナミアカヒレタビラ Acheilognathus tabira jordani |
5件 | 絶滅危惧ⅠA類 (CR) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ミヤコタナゴ Tanakia tanago |
7件 | 絶滅危惧ⅠA類 (CR) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ムギツク Pungtungia herzi |
7件 | |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
モツゴ Pseudorasbora parva |
7件 | |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ヤチウグイ Phoxinus perenurus sachalinensis |
1件 | 準絶滅危惧 (NT) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ヤマナカハヤ Phoxinus lagowskii yamamotis |
1件 | 情報不足 (DD) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ヤリタナゴ Tanakia lanceolata |
39件 | 準絶滅危惧 (NT) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ヨドゼゼラ Biwia yodoensis |
4件 | 絶滅危惧ⅠB類 (EN) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
ワタカ Ischikauia steenackeri |
4件 | 絶滅危惧ⅠA類 (CR) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
中通島のタカハヤ Phoxinus oxycephalus jouyi |
1件 | |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
宇久島のタカハヤ Phoxinus oxycephalus jouyi |
1件 | |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
本州のジュウサンウグイ Tribolodon brandtii brandtii |
0件 | 地域個体群 (LP) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
東北地方のエゾウグイ Tribolodon sachalinensis |
1件 | 地域個体群 (LP) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
玄界灘側のアブラボテ Tanakia limbata |
1件 | |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
琵琶湖のコイ在来型 Cyprinus carpio |
0件 | 地域個体群 (LP) |
| 魚類 | コイ Cypriniformes |
コイ Cyprinidae |
阿武隈高地のエゾウグイ Tribolodon sachalinensis |
1件 |
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