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上位分類群	目名	科名	和名／学名	指定都道府県数	環境省カテゴリ
哺乳類	ウサギ目 Lagomorpha	ウサギ科 Leporidae	アマミノクロウサギ Pentalagus furnessi	1件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
哺乳類	ウサギ目 Lagomorpha	ウサギ科 Leporidae	キュウシュウノウサギ Lepus brachyurus brachyurus	4件
哺乳類	ウサギ目 Lagomorpha	ウサギ科 Leporidae	サドノウサギ Lepus brachyurus lyoni	1件	準絶滅危惧 (NT)
哺乳類	ウサギ目 Lagomorpha	ナキウサギ科 Ochotonidae	エゾナキウサギ Ochotona hyperborea yesoensis	1件	準絶滅危惧 (NT)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ Capricornis crispus	19件
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ九州地方地域個体群 Capricornis crispus	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ四国地方地域個体群 Capricornis crispus	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ紀伊山地地域個体群 Capricornis crispus	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ鈴鹿山地地域個体群 Capricornis crispus	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウマ目（奇蹄目） PERISSODACTYLA	ウマ科 Equidae	野生ウマ都井岬地域個体群 Equus caballus	1件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オオコウモリ科 Pteropodidae	エラブオオコウモリ Pteropus dasymallus dasymallus	1件	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オオコウモリ科 Pteropodidae	オガサワラオオコウモリ Pteropus pselaphon	0件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オオコウモリ科 Pteropodidae	オキナワオオコウモリ Pteropus loochoensis	1件	絶滅 (EX)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オオコウモリ科 Pteropodidae	オリイオオコウモリ Pteropus dasymallus inopinatus	2件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オオコウモリ科 Pteropodidae	ダイトウオオコウモリ Pteropus dasymallus daitoensis	1件	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オオコウモリ科 Pteropodidae	ヤエヤマオオコウモリ Pteropus dasymallus yayeyamae	1件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オヒキコウモリ科 Molossidae	オヒキコウモリ Tadarida insignis	20件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オヒキコウモリ科 Molossidae	オヒキコウモリ伊東地域個体群 Tadarida insignis	1件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オヒキコウモリ科 Molossidae	スミイロオヒキコウモリ Tadarida latouchei	1件	情報不足 (DD)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	カグラコウモリ科 Hipposideridae	カグラコウモリ Hipposideros turpis	1件

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