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上位分類群	目名	科名	和名／学名	指定都道府県数	環境省カテゴリ
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	クロオオアブラコウモリ Hypsugo alaschanicus velox	2件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	クロホオヒゲコウモリ Myotis pruinosus	24件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	コテングコウモリ Murina ussuriensis	35件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	コヤマコウモリ Nyctalus furvus	5件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	シナノホオヒゲコウモリ Myotis ikonnikovi hosonoi	3件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	シナノホオヒゲコウモリ中国地方個体群 Myotis ikonnikovi hosonoi	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	シナノホオヒゲコウモリ紀伊半島個体群 Myotis ikonnikovi hosonoi	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	チチブコウモリ Barbastella leucomelas	16件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	チチブコウモリ四国地域個体群 Barbastella leucomelas	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	チチブコウモリ本州地域個体群 Barbastella leucomelas	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	テングコウモリ Murina leucogaster	38件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヒナコウモリ Vespertilio sinensis	35件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヒナコウモリ東松島町地域個体群 Vespertilio sinensis	1件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヒメヒナコウモリ Vespertilio murinus	2件	情報不足 (DD)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヒメホオヒゲコウモリ Myotis ikonnikovi ikonnikovi	19件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	フジホオヒゲコウモリ Myotis ikonnikovi fujiensis	2件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ホンドノレンコウモリ Myotis nattereri bombinus	31件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	モモジロコウモリ Myotis macrodactylus	25件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	モリアブラコウモリ Pipistrellus endoi	21件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヤマコウモリ Nyctalus aviator	37件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)

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