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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	大分	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ニホンイトヨ Gasterosteus nipponicus	大分	絶滅 (EX)
魚類	スズキ Perciformes	カジカ Cottidae	ウツセミカジカ（回遊型） Cottus reinii	大分	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ハンミョウ Cicindelidae	カワラハンミョウ九州亜種 Cicindela laetescripta kiushuensis	大分	絶滅 (EX)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	オサムシ Carabidae	コゾノメクラチビゴミムシ Rakantrechus (Paratrechiama) elegans	大分	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ゲンゴロウ Dytiscidae	スジゲンゴロウ Hydaticus satoi	大分	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	タマムシ Buprestidae	ツメアカナガヒラタタマムシ Trachypteris obscurata	大分	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	ヒメシダ Thelypteridaceae	ホソバショリマ Thelypteris beddomei	大分	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	デンジソウ Marsileaceae	デンジソウ Marsilea quadrifolia	大分	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	クマ科 Ursidae	ツキノワグマ Ursus thibetanus japonicus	熊本	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	熊本	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	熊本	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
鳥類	スズメ Passeriformes	カラス Corvidae	オナガ Cyanopica cyana japonica	熊本	絶滅 (EX)
魚類	ナマズ Siluriformes	アカザ Amblycipitidae	アカザ Liobagrus reinii	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	イトヨ Gasterosteus aculeatus aculeatus	熊本	絶滅 (EX)
魚類	スズキ Perciformes	カジカ Cottidae	カマキリ Cottus kazika	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
昆虫類	バッタ ORTHOPTERA	バッタ Acrididae	カワラバッタ Eusphingonotus japonicus	熊本	絶滅 (EX)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ゲンゴロウ Dytiscidae	キボシツブゲンゴロウ Japanolaccophilus nipponensis	熊本	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ゲンゴロウ Dytiscidae	コクロマメゲンゴロウ Platambus insolitus	熊本	絶滅 (EX)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ゲンゴロウ Dytiscidae	スジゲンゴロウ Hydaticus satoi	熊本	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)

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