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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
鳥類	スズメ Passeriformes	ミソサザイ Troglodytidae	ダイトウミソサザイ Troglodytes troglodytes orii	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
鳥類	スズメ Passeriformes	シジュウカラ Paridae	ダイトウヤマガラ Parus varius orii	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
魚類	サケ Salmoniformes	アユ Plecoglossidae	リュウキュウアユ Plecoglossus altivelis ryukyuensis	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
無脊椎動物	盤足 Discopoda	カワザンショウガイ Assimineidae	リュウキュウカワザンショウ Assiminea sp. D	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
無脊椎動物	マイマイ Stylommatophora	ニッポンマイマイ Camaenidae	トクノシマケハダシワクチマイマイ Moellendorffia tokunoensis	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
無脊椎動物	マルスダレガイ Veneroida	マルスダレガイ Veneridae	キルン Meretrix sp. A	沖縄	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	ゼンマイ Osmundaceae	ゼンマイ Osmunda japonica	沖縄	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	イノモトソウ Pteridaceae	ヒメウラジロ Cheilanthes argentea	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	チャセンシダ Aspleniaceae	トラノオシダ Asplenium incisum	沖縄	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	ナナバケシダ Tectariaceae	ウスバシダモドキ Tectaria dissecta	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	ウラボシ Polypodiaceae	クリハラン Neolepisorus ensatus	沖縄	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	ジュンサイ Cabombaceae	ジュンサイ Brasenia schreberi	沖縄	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	マメ Fabaceae	ソロハギ Flemingia strobilifera	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	トチカガミ Hydrocharitaceae	トチカガミ Hydrocharis dubia	沖縄	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	ラン Orchidaceae	ジンヤクラン Arachnis labrosa	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	ミクリ Sparganiaceae	ヒメミクリ Sparganium subglobosum	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	スミレ Violaceae	オリヅルスミレ Viola stoloniflora	沖縄	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ツツジ Ericaceae	リュウキュウアセビ Pieris japonica ssp. koidzumiana	沖縄	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ツツジ Ericaceae	クメジマツツジ Rhododendron amanoi var. glandulistylum	沖縄	野生絶滅 (EW)

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