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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
地衣類	－－		ヌマジリゴケ Erioderma tomentosum	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
地衣類	－－		ハコネゴンゲンゴケ Hypotrachyna revoluta	佐賀	絶滅種
地衣類	－－		ヘラゴケ Icmadophila japonica	広島	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅰ類 (CR+EN)
地衣類	－－		ホソゲジゲジゴケ Heterodermia angustiloba	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
地衣類	－－		マユゴケ Agonimiella pacifica	佐賀	絶滅種
地衣類	－－		ヨコワサルオガセ Usnea diffracta	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)
地衣類	－－		ラッパゲジゲジゴケ Heterodermia hypochraea	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)
菌類	変形菌 Myxomycetes	ケホコリ Trichiales	スミレヒモホコリ Perichaena tessellata	栃木	絶滅
菌類	変形菌 Myxomycetes	モジホコリ Physarales	ナスフクロホコリ Physarum nasuense	栃木	絶滅
菌類	接合菌 Zygomycetes	ケカビ Mucorales	ドウタイクスダマカビ Cunninghamella homothallica	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	スッポンタケ Phallales	ウスキキヌガサタケ Dictyophora indusiata f. lutea	京都	絶滅種	情報不足 (DD)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	スッポンタケ Phallales	キイロスッポンタケ Phallus costatus	京都	絶滅種
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	スッポンタケ Phallales	ハハジマアコウショウロ Circulocolumella hahashimensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	チャダイゴケ Nidulariales	ムニンチャダイゴケ Cyathus boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	ハラタケ Agaricales	オオミノアカヤマタケ Hygrocybe macrospora	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	ハラタケ Agaricales	オガサワライタチタケ Psathyrella boninense	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	ハラタケ Agaricales	オガサワラキハツタケ Russula boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	ハラタケ Agaricales	オガサワラツムタケ Gymnopilus noviholocirrhus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	ハラタケ Agaricales	オガサワラハツタケ Lactarius ogasawarashimensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	真正担子菌 Eubasidiomycetes	ハラタケ Agaricales	タマノリイグチ Xerocomus astraeicola	京都	絶滅種

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