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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus	京都	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus	奈良	野生絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	群馬	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	埼玉	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	東京	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	神奈川	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ヤリタナゴ Tanakia lanceolata	群馬	野生絶滅 (EW)	準絶滅危惧 (NT)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ヤリタナゴ Tanakia lanceolata	東京	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ヤリタナゴ Tanakia lanceolata	神奈川	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
魚類	コイ Cypriniformes	ドジョウ Cobitidae	ヨドコガタスジシマドジョウ Cobitis minamorii yodoensis	京都	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	フクドジョウ Nemacheilidae	ホトケドジョウ Lefua echigonia	富山	絶滅+野生絶滅	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	サケ Salmoniformes	アユ Plecoglossidae	リュウキュウアユ Plecoglossus altivelis ryukyuensis	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	サケ Salmoniformes	キュウリウオ Osmeridae	ワカサギ Hypomesus nipponensis	群馬	絶滅 (EX)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	イトウ Hucho perryi	青森	絶滅野生生物 (EXランク)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	クニマス Oncorhynchus kawamurae	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	クニマス Oncorhynchus kawamurae	秋田	絶滅種 (EX)	野生絶滅 (EW)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	サケ Oncorhynchus keta	長野	野生絶滅 (EW)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	サケ Oncorhynchus keta	広島	絶滅 (EX)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	サケ Oncorhynchus keta	福岡	野生絶滅 (EW)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	紀伊半島のヤマトイワナ（キリクチ） Salvelinus leucomaenis japonicus	和歌山	絶滅 (EX)	地域個体群 (LP)

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