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上位分類群	目名	科名	和名／学名	指定都道府県数	環境省カテゴリ
哺乳類	アザラシ目（鰭脚目） Pinnipedia	アシカ科 Otariidae	トド Eumetopias jubatus	2件	準絶滅危惧 (NT)
哺乳類	アザラシ目（鰭脚目） Pinnipedia	アシカ科 Otariidae	ニホンアシカ Zalophus japonicus	9件	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	シカ科 Cervidae	キュウシュウジカ甑島列島地域個体群 Cervus nippon	1件
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	シカ科 Cervidae	ニホンジカ馬毛島地域個体群 Cervus nippon	1件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	シカ科 Cervidae	ホンシュウジカ Cervus nippon centralis	3件
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	シカ科 Cervidae	ヤクシカ Cervus nippon yakushimae	1件
哺乳類	クジラ目（鯨） Cetacea	ネズミイルカ科 Phocoenidae	スナメリ Neophocaena phocaenoides	10件
哺乳類	クジラ目（鯨） Cetacea	ネズミイルカ科 Phocoenidae	スナメリ仙台湾－東京湾海域個体群 Neophocaena phocaenoides	1件
哺乳類	クジラ目（鯨） Cetacea	ネズミイルカ科 Phocoenidae	ネズミイルカ Phocoena phocoena	1件
哺乳類	クジラ目（鯨） Cetacea	マイルカ科 Delphinidae	コビレゴンドウ Globicephala macrorhynchus	1件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	カグラコウモリ科 Hipposideridae	カグラコウモリ Hipposideros turpis	1件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	カグラコウモリ科 Hipposideridae	カグラコウモリ与那国島個体群 Hipposideros turpis	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	カグラコウモリ科 Hipposideridae	カグラコウモリ波照間島個体群 Hipposideros turpis	0件	地域個体群 (LP)
鳥類	カイツブリ Podicipediformes	カイツブリ Podicipedidae	アカエリカイツブリ Podiceps grisegena holboellii	7件
鳥類	カイツブリ Podicipediformes	カイツブリ Podicipedidae	カイツブリ Tachybaptus ruficollis poggei	10件
鳥類	カイツブリ Podicipediformes	カイツブリ Podicipedidae	カンムリカイツブリ Podiceps cristatus cristatus	13件
鳥類	カイツブリ Podicipediformes	カイツブリ Podicipedidae	ダイトウカイツブリ Tachybaptus ruficollis kunikyonis	1件
鳥類	カイツブリ Podicipediformes	カイツブリ Podicipedidae	ハジロカイツブリ Podiceps nigricollis nigricollis	4件
鳥類	カイツブリ Podicipediformes	カイツブリ Podicipedidae	ミミカイツブリ Podiceps auritus auritus	4件
鳥類	カイツブリ Podicipediformes	カイツブリ Podicipedidae	青森県のカンムリカイツブリ繁殖個体群 Podiceps cristatus cristatus	0件	地域個体群 (LP)

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