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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
菌類	ヒダナシタケ Aphyllophorales	－－	エヒメウスバタケ Hydnochaete ravenelii	愛媛	絶滅 (EX)	情報不足 (DD)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	Ｌｅｎｔｉｎｕｓｌａｍｅｌｌｉｐｏｒｕｓ Lentinus lamelliporus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ムラサキチャヒラタケ Crepidotus subpurpureus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ムニンヒメサカズキタケ Clitocybe castaneofloccosa	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ムニンヒメカラカサタケ Lepiota boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ムニンヒトヨタケ Coprinus boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ムニンチャモミウラタケ Rhodophyllus brunneolus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	チャダイゴケ Nidulariales	－－	ムニンチャダイゴケ Cyathus boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ムニンチヂミタケ Leptoglossum boninense	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ムニンキヤマタケ Hygrocybe miniatostriata	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ヘゴシロカタハ Pleurotus cyatheae	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	フタイロコガサタケ Camarophyllus microbicolor	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	フサベニヒダタケ Pluteus horridilamellus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ハハノツエタケ Collybia matris	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－－	ハハジマモリノカサ Agaricus hahashimensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	スッポンタケ Phallales	－－	ハハジマアコウショウロ Circulocolumella hahashimensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ヒダナシタケ Aphyllophorales	－－	ニセカンバタケ Ganoderma colossus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ケカビ Mucorales	－－	ドウタイクスダマカビ Cunninghamella homothallica	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
菌類	ケホコリ Trichiales	－－	スミレヒモホコリ Perichaena tessellata	栃木	絶滅
菌類	モジホコリ Physarales	－－	ナスフクロホコリ Physarum nasuense	栃木	絶滅

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