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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
菌類	ハラタケ Agaricales	－	フタイロコガサタケ Camarophyllus microbicolor	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムニンチャモミウラタケ Rhodophyllus brunneolus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムラサキチャヒラタケ Crepidotus subpurpureus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ハハノツエタケ Collybia matris	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムニンヒメサカズキタケ Clitocybe castaneofloccosa	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムニンヒメカラカサタケ Lepiota boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムニンヒトヨタケ Coprinus boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ヒメノガステル Hymenogastrales	－	スナタマゴタケ Endoptychum agaricoides	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ハハジマモリノカサ Agaricus hahashimensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
地衣類	－	－	シロツノゴケ Siphula ceratites	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
地衣類	－	－	ヌマジリゴケ Erioderma tomentosum	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
地衣類	－	－	ホソゲジゲジゴケ Heterodermia angustiloba	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	カヤツリグサ Cyperaceae	ホクトガヤツリ Cyperus procerus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	ラン Orchidaceae	キノエササラン Liparis bootanensis var. uchiyamae	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	ホシクサ Eriocaulaceae	コシガヤホシクサ Eriocaulon heleocharioides	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	ベンケイソウ Crassulaceae	リュウキュウベンケイ Kalanchoe spathulata	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	マメ Fabaceae	ナルトオウギ Astragalus sikokianus	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	スミレ Violaceae	オリヅルスミレ Viola stoloniflora	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	イヌサフラン Colchicaceae	キバナホウチャクソウ Disporum uniflorum	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	モクレン Magnoliaceae	コブシモドキ Magnolia pseudokobus	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)

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