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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
蘚苔類	ギボウシゴケ	ギボウシゴケ	シモフリゴケ Racomitrium lanuginosum	京都	絶滅種
蘚苔類	イヌマゴケ	イタチゴケ	リスゴケ Dozya japonica	京都	絶滅種
蘚苔類	キセルゴケ	キセルゴケ	クマノチョウジゴケ Buxbaumia minakatae	大阪	絶滅
蘚苔類	ホンマゴケ	チョウチンゴケ	タチチョウチンゴケ Orthomnion dilatatum	大阪	絶滅	情報不足 (DD)
蘚苔類	シトネゴケ	ヤナギゴケ	ササオカゴケ Sasaokaea aomoriensis	大阪	絶滅	準絶滅危惧 (NT)
蘚苔類	シッポゴケ	キンシゴケ	アオゴケ Saelania glaucescens	兵庫	絶滅（EX）
蘚苔類	シトネゴケ	シノブゴケ	マキハハリゴケ Claopodium assurgens	奈良	絶滅種
蘚苔類	シトネゴケ	ナガハシゴケ	タマコモチイトゴケ Gammiella tonkinensis	岡山	絶滅
藻類	シャジクモ Charales	シャジクモ Characeae	イケダシャジクモ Chara fibrosa var. brevibracteata	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
藻類	シャジクモ Charales	シャジクモ Characeae	ハコネシャジクモ Chara globularis var. hakonensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
藻類	シャジクモ Charales	シャジクモ Characeae	キザキフラスコモ Nitella minispora	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
藻類	ウシケノリ Bangiales	ウシケノリ Bangiaceae	コスジノリ Porphyra angusta	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
藻類	シャジクモ Charales	シャジクモ Characeae	シラタマモ Lamprothamnium succinctum	秋田	絶滅種 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
藻類	シャジクモ Charales	シャジクモ Characeae	オトメフラスコモ Nitella hyalina	秋田	絶滅種 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
藻類	チロプテリス Tilopteridales	ムチモ Cutleriaceae	ムチモ Mutimo cylindricus	茨城	絶滅
藻類	コンブ Laminariales	コンブ Laminariaceae	カジメ Ecklonia cava	茨城	絶滅
藻類	カクレイト Cryptonemiales	イトフノリ Gloiosiphoniaceae	ナガオバネ Schimmelmannia plumosa	茨城	絶滅	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
藻類	スギノリ Gigartinales	シストクロニウム Cystocloniaceae	サイダイバラ Hypnea saidana	茨城	絶滅
藻類	スギノリ Gigartinales	ナミノハナ Rhizophyllidaceae	ナミノハナ Portieria japonica	茨城	絶滅
藻類	シャジクモ Charales	シャジクモ Characeae	テガヌマフラスコモ Nitella furcata var. fallosa	埼玉	絶滅 (EX)	野生絶滅 (EW)

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