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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
魚類	コイ Cypriniformes	ドジョウ Cobitidae	ヨドコガタスジシマドジョウ Cobitis minamorii yodoensis	京都	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus	長崎	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	東京	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	新潟	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	スワモロコ Gnathopogon elongatus suwae	長野	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
魚類	コイ Cypriniformes	フクドジョウ Nemacheilidae	ホトケドジョウ Lefua echigonia	富山	絶滅+野生絶滅	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus	奈良	野生絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	埼玉	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	埼玉	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	タナゴ Acheilognathus melanogaster	埼玉	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	山形	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	神奈川	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	タナゴ Acheilognathus melanogaster	神奈川	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	神奈川	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	スワモロコ Gnathopogon elongatus suwae	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ヤリタナゴ Tanakia lanceolata	神奈川	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	セボシタビラ Acheilognathus tabira nakamurae	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	カネヒラ Acheilognathus rhombeus	長崎	絶滅 (EX)
魚類	コイ Cypriniformes	アユモドキ Botiidae	アユモドキ Parabotia curtus	広島	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)

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