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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	大分	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	ヒメシダ Thelypteridaceae	ホソバショリマ Thelypteris beddomei	大分	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	デンジソウ Marsileaceae	デンジソウ Marsilea quadrifolia	大分	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	イノモトソウ Pteridaceae	オキナワクジャク Adiantum flabellulatum	熊本	絶滅 (EX)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	アヤメ Iridaceae	アヤメ Iris sanguinea	熊本	絶滅 (EX)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	クサスギカズラ Asparagaceae	ハマタマボウキ Asparagus kiusianus	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	カヤツリグサ Cyperaceae	ハタベスゲ Carex latisquamea	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	イネ Poaceae	ビロードキビ Urochloa villosa	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ムラサキ Boraginaceae	ムラサキ Lithospermum murasaki	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	シソ Lamiaceae	ルリハッカ Amethystea caerulea	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ミツガシワ Menyanthaceae	ミツガシワ Menyanthes trifoliata	熊本	絶滅 (EX)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	キク Asteraceae	ミコシギク Leucanthemella linearis	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	バラ Rosaceae	ツクシカイドウ Malus hupehensis	熊本	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
魚類	ナマズ Siluriformes	アカザ Amblycipitidae	アカザ Liobagrus reinii	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	イトヨ Gasterosteus aculeatus aculeatus	熊本	絶滅 (EX)
魚類	スズキ Perciformes	カジカ Cottidae	カマキリ Cottus kazika	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
鳥類	スズメ Passeriformes	カラス Corvidae	オナガ Cyanopica cyana japonica	熊本	絶滅 (EX)
昆虫類	チョウ LEPIDOPTERA	シジミチョウ Lycaenidae	ルーミスシジミ Panchala ganesa loomisi	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ミズスマシ Gyrinidae	ツマキレオナガミズスマシ Orectochilus agilis	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ゲンゴロウ Dytiscidae	スジゲンゴロウ Hydaticus satoi	熊本	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)

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