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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ミナミトミヨ Pungitius kaibarae	兵庫	絶滅	絶滅 (EX)
魚類	ヤツメウナギ Petromyzontiformes	ヤツメウナギ Petromyzontidae	スナヤツメ類 Lethenteron sp. N and/or sp. S	愛媛	絶滅 (EX)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ニホンイトヨ Gasterosteus nipponicus	愛媛	絶滅 (EX)
魚類	サケ Salmoniformes	キュウリウオ Osmeridae	ワカサギ Hypomesus nipponensis	群馬	絶滅 (Eｘ)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	スイゲンゼニタナゴ Rhodeus smithii ssp.	兵庫	絶滅	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	サケ Oncorhynchus keta	福岡	野生絶滅 (EW)
魚類	スズキ Perciformes	カジカ Cottidae	カジカ中卵型 Cottus sp.	福岡	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	ヤツメウナギ Petromyzontiformes	ヤツメウナギ Petromyzontidae	カワヤツメ Lethenteron camtschaticum	福岡	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ニホンイトヨ Gasterosteus nipponicus	富山	絶滅+野生絶滅（EX+EW）
魚類	コイ Cypriniformes	フクドジョウ Nemacheilidae	ホトケドジョウ Lefua echigonia	富山	絶滅+野生絶滅（EX+EW）	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ハリヨ Gasterosteus aculeatus ssp. 2	三重	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ヤリタナゴ Tanakia lanceolata	群馬	野生絶滅 (Ew)	準絶滅危惧 (NT)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ムサシトミヨ Pungitius sp.	群馬	絶滅 (Eｘ)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	タナゴ Acheilognathus melanogaster	群馬	絶滅 (Eｘ)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	ナマズ Siluriformes	アカザ Amblycipitidae	アカザ Liobagrus reinii	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ニホンイトヨ Gasterosteus nipponicus	熊本	絶滅 (EX)
魚類	スズキ Perciformes	カジカ Cottidae	カマキリ Cottus kazika	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	群馬	絶滅 (Eｘ)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	群馬	絶滅 (Eｘ)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	シナイモツゴ Pseudorasbora pumila	群馬	絶滅 (Eｘ)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)

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