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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
鳥類	チドリ Charadriiformes	シギ Scolopacidae	オオジシギ Gallinago hardwickii	神奈川	絶滅 (EX)
鳥類	ハト Columbiformes	ハト Columbidae	カラスバト Columba janthina janthina	神奈川	絶滅 (EX)
両生類	有尾 Caudata	オオサンショウウオ Cryptobranchidae	オオサンショウウオ Andrias japonicus	福井	県域絶滅	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
両生類	有尾 Caudata	オオサンショウウオ Cryptobranchidae	オオサンショウウオ Andrias japonicus	和歌山	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ニホンイトヨ Gasterosteus nipponicus	愛媛	絶滅 (EX)
魚類	ヤツメウナギ Petromyzontiformes	ヤツメウナギ Petromyzontidae	スナヤツメ類 Lethenteron sp. N and/or sp. S	愛媛	絶滅 (EX)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ミナミトミヨ Pungitius kaibarae	兵庫	絶滅	絶滅 (EX)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ミナミトミヨ Pungitius kaibarae	京都	絶滅種	絶滅 (EX)
魚類	コイ Cypriniformes	ドジョウ Cobitidae	ヨドコガタスジシマドジョウ Cobitis minamorii yodoensis	京都	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus	京都	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	ナマズ Siluriformes	アカザ Amblycipitidae	アカザ Liobagrus reinii	宮崎	絶滅 (EX-r,g,d)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	スズキ Perciformes	カジカ Cottidae	カジカ Cottus pollux	和歌山	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
魚類	スズキ Perciformes	キス Sillaginidae	アオギス Sillago parvisquamis	和歌山	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	東京	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	スズキ Perciformes	ケツギョ Sinipercidae	オヤニラミ Coreoperca kawamebari	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	東京	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	タナゴ Acheilognathus melanogaster	東京	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	アカヒレタビラ Acheilognathus tabira erythropterus	東京	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	サケ Salmoniformes	シラウオ Salangidae	シラウオ Salangichthys microdon	東京	絶滅 (EX)
魚類	スズキ Perciformes	キス Sillaginidae	アオギス Sillago parvisquamis	東京	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)

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