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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	バラ Rosaceae	キンキマメザクラ Cerasus incisa var. kinkiensis	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	ニシキギ Celastraceae	クロヅル Tripterygium regelii	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	ミソハギ Lythraceae	ホザキキカシグサ Rotala rotundifolia	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	アブラナ Brassicaceae	ハナハタザオ Dontostemon dentatus	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	モウセンゴケ Droseraceae	ヒュウガコモウセンゴケ Drosera tokaiensis ssp. hyugaensis	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	ナデシコ Caryophyllaceae	フシグロセンノウ Silene miqueliana	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	ナデシコ Caryophyllaceae	ウシオツメクサ Spergularia marina	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	ツリフネソウ Balsaminaceae	ハガクレツリフネ Impatiens hypophylla	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	ツリフネソウ Balsaminaceae	キツリフネ Impatiens noli-tangere	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ムラサキ Boraginaceae	ムラサキ Lithospermum murasaki	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ナス Solanaceae	ハシリドコロ Scopolia japonica	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	モクレン Magnoliaceae	タムシバ Magnolia salicifolia	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ハマウツボ Orobanchaceae	クチナシグサ Monochasma sheareri	長崎	絶滅 (EX)
無脊椎動物	フネガイ Arcoida	フネガイ Arcidae	ヒメアカガイ Scapharca troscheli	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅰ類 (CR+EN)
無脊椎動物	フネガイ Arcoida	フネガイ Arcidae	ビョウブガイ Trisidos kiyonoi	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅰ類 (CR+EN)
鳥類	キツツキ Piciformes	キツツキ Picidae	キタタキ Dryocopus javensis richardsi	長崎	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
魚類	ヤツメウナギ Petromyzontiformes	ヤツメウナギ Petromyzontidae	ミナミスナヤツメ Lethenteron hattai	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	カネヒラ Acheilognathus rhombeus	長崎	絶滅 (EX)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	セボシタビラ Acheilognathus tabira nakamurae	長崎	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus	長崎	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)

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