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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
魚類	スズキ Perciformes	カジカ Cottidae	カマキリ Cottus kazika	山梨	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	スズキ Perciformes	カジカ Cottidae	ウツセミカジカ（回遊型） Cottus reinii	高知	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	クニマス Oncorhynchus kawamurae	秋田	絶滅種 (EX)	野生絶滅 (EW)
魚類	チョウザメ Acipenseriformes	チョウザメ Acipenseridae	チョウザメ Acipenser medirostris	北海道	絶滅 (Ex)	絶滅 (EX)
魚類	スズキ Perciformes	キス Sillaginidae	アオギス Sillago parvisquamis	徳島	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	サケ Oncorhynchus keta	長野	野生絶滅 (EW)
魚類	ウナギ Anguilliformes	ウナギ Anguillidae	ニホンウナギ Anguilla japonica	長野	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	スワモロコ Gnathopogon elongatus suwae	長野	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	ニホンイトヨ Gasterosteus nipponicus	長崎	絶滅 (EX)
魚類	サケ Salmoniformes	アユ Plecoglossidae	リュウキュウアユ Plecoglossus altivelis ryukyuensis	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	山形	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	タナゴ Acheilognathus melanogaster	埼玉	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	埼玉	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ミヤコタナゴ Tanakia tanago	埼玉	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus	奈良	野生絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ゼニタナゴ Acheilognathus typus	新潟	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	スズキ Perciformes	ハゼ Gobiidae	ドウクツミミズハゼ Luciogobius albus	島根	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	カワヒガイ Sarcocheilichthys variegatus variegatus	長崎	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
魚類	スズキ Perciformes	キス Sillaginidae	アオギス Sillago parvisquamis	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)

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