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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ナス Solanaceae	ハシリドコロ Scopolia japonica	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	モクレン Magnoliaceae	タムシバ Magnolia salicifolia	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ハマウツボ Orobanchaceae	クチナシグサ Monochasma sheareri	長崎	絶滅 (EX)
維管束植物	シダ植物 PTERIDOPHYTA	イノモトソウ Pteridaceae	オキナワクジャク Adiantum flabellulatum	熊本	絶滅 (EX)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	アヤメ Iridaceae	アヤメ Iris sanguinea	熊本	絶滅 (EX)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	クサスギカズラ Asparagaceae	ハマタマボウキ Asparagus kiusianus	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	カヤツリグサ Cyperaceae	ハタベスゲ Carex latisquamea	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	単子葉類 MONOCOTYLEDONEAE	イネ Poaceae	ビロードキビ Urochloa villosa	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ムラサキ Boraginaceae	ムラサキ Lithospermum murasaki	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	シソ Lamiaceae	ルリハッカ Amethystea caerulea	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ミツガシワ Menyanthaceae	ミツガシワ Menyanthes trifoliata	熊本	絶滅 (EX)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	キク Asteraceae	ミコシギク Leucanthemella linearis	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	バラ Rosaceae	ツクシカイドウ Malus hupehensis	熊本	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)
無脊椎動物	イシサンゴ Scleractinia	クサビライシ Fungiidae	マンジュウイシモドキ Cycloseris vaughani	熊本	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	熊本	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	クマ科 Ursidae	ツキノワグマ Ursus thibetanus japonicus	熊本	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	熊本	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
鳥類	スズメ Passeriformes	カラス Corvidae	オナガ Cyanopica cyana japonica	熊本	絶滅 (EX)
魚類	ナマズ Siluriformes	アカザ Amblycipitidae	アカザ Liobagrus reinii	熊本	絶滅 (EX)	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
魚類	トゲウオ Gasterosteiformes	トゲウオ Gasterosteidae	イトヨ Gasterosteus aculeatus aculeatus	熊本	絶滅 (EX)

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