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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
地衣類	－	－	ハコネゴンゲンゴケ Hypotrachyna revoluta	佐賀	絶滅種
地衣類	－	－	ヤマトカワホリゴケ Collema japonicum	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)
地衣類	－	－	ゴヘイゴケ Imshaugia aleurites	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)
地衣類	－	－	ラッパゲジゲジゴケ Heterodermia hypochraea	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)
地衣類	－	－	シロツノゴケ Siphula ceratites	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
地衣類	－	－	ヌマジリゴケ Erioderma tomentosum	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
地衣類	－	－	ホソゲジゲジゴケ Heterodermia angustiloba	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
地衣類	－	－	ヨコワサルオガセ Usnea diffracta	千葉	消息不明・絶滅生物 (X)
地衣類	－	－	ツブミゴケ Gymnoderma insulare	福岡	絶滅 (EX)	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
地衣類	－	－	イコマウメノキゴケ Hypotrachyna ikomae	佐賀	絶滅種
地衣類	－	－	ヘラゴケ Icmadophila japonica	広島	絶滅 (EX)	準絶滅危惧 (NT)
地衣類	－	－	マユゴケ Agonimiella pacifica	佐賀	絶滅種
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ハハジマモリノカサ Agaricus hahashimensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ヒメノガステル Hymenogastrales	－	スナタマゴタケ Endoptychum agaricoides	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムニンヒトヨタケ Coprinus boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムニンヒメカラカサタケ Lepiota boninensis	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムニンヒメサカズキタケ Clitocybe castaneofloccosa	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ハハノツエタケ Collybia matris	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムラサキチャヒラタケ Crepidotus subpurpureus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
菌類	ハラタケ Agaricales	－	ムニンチャモミウラタケ Rhodophyllus brunneolus	環境省	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)

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