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上位分類群	目名	科名	和名／学名	指定都道府県数	環境省カテゴリ
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	チチブコウモリ本州地域個体群 Barbastella leucomelas	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	テングコウモリ Murina leucogaster	38件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヒナコウモリ Vespertilio sinensis	35件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヒナコウモリ東松島町地域個体群 Vespertilio sinensis	1件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヒメヒナコウモリ Vespertilio murinus	3件	情報不足 (DD)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヒメホオヒゲコウモリ Myotis ikonnikovi ikonnikovi	19件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	フジホオヒゲコウモリ Myotis ikonnikovi fujiensis	2件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ホンドノレンコウモリ Myotis nattereri bombinus	31件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	モモジロコウモリ Myotis macrodactylus	25件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	モリアブラコウモリ Pipistrellus endoi	21件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヤマコウモリ Nyctalus aviator	37件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ヤンバルホオヒゲコウモリ Myotis yanbarensis	2件	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	ユビナガコウモリ Miniopterus schreibersi	36件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	リュウキュウテングコウモリ Murina ryukyuana	2件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	ヒナコウモリ科 Vespertilionidae	リュウキュウユビナガコウモリ Miniopterus fuscus	2件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オヒキコウモリ科 Molossidae	オヒキコウモリ Tadarida insignis	20件	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オヒキコウモリ科 Molossidae	オヒキコウモリ伊東地域個体群 Tadarida insignis	1件
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オヒキコウモリ科 Molossidae	スミイロオヒキコウモリ Tadarida latouchei	1件	情報不足 (DD)
哺乳類	サル目（霊長目） Primates	オナガザル科 Cercopithecidae	ニホンザル伊豆・愛鷹・熱海地域個体群 Macaca fuscata	1件
哺乳類	サル目（霊長目） Primates	オナガザル科 Cercopithecidae	ニホンザル種子島地域個体群 Macaca fuscata	1件

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