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上位分類群	目名	科名	和名／学名	指定都道府県数	環境省カテゴリ
哺乳類	アザラシ目（鰭脚目） Pinnipedia	アザラシ科 Phocidae	アゴヒゲアザラシ Erignathus barbatus	1件
哺乳類	アザラシ目（鰭脚目） Pinnipedia	アザラシ科 Phocidae	ゴマフアザラシ夏期定着個体群 Phoca largha	1件
哺乳類	アザラシ目（鰭脚目） Pinnipedia	アザラシ科 Phocidae	ゼニガタアザラシ Phoca vitulina	1件	準絶滅危惧 (NT)
哺乳類	アザラシ目（鰭脚目） Pinnipedia	アシカ科 Otariidae	トド Eumetopias jubatus	2件	準絶滅危惧 (NT)
哺乳類	アザラシ目（鰭脚目） Pinnipedia	アシカ科 Otariidae	ニホンアシカ Zalophus japonicus	9件	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
哺乳類	ウサギ目 Lagomorpha	ウサギ科 Leporidae	アマミノクロウサギ Pentalagus furnessi	1件	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
哺乳類	ウサギ目 Lagomorpha	ウサギ科 Leporidae	キュウシュウノウサギ Lepus brachyurus brachyurus	4件
哺乳類	ウサギ目 Lagomorpha	ウサギ科 Leporidae	サドノウサギ Lepus brachyurus lyoni	1件	準絶滅危惧 (NT)
哺乳類	ウサギ目 Lagomorpha	ナキウサギ科 Ochotonidae	エゾナキウサギ Ochotona hyperborea yesoensis	1件	準絶滅危惧 (NT)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	イノシシ科 Suidae	ニホンイノシシ Sus scrofa leucomystax	4件
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	イノシシ科 Suidae	ニホンイノシシ甑島列島地域個体群 Sus scrofa leucomystax	1件
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	イノシシ科 Suidae	リュウキュウイノシシ Sus scrofa riukiuanus	1件
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	イノシシ科 Suidae	リュウキュウイノシシ徳之島地域個体群 Sus scrofa riukiuanus	1件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ Capricornis crispus	19件
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ九州地方地域個体群 Capricornis crispus	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ四国地方地域個体群 Capricornis crispus	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ紀伊山地地域個体群 Capricornis crispus	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	ウシ科 Bovidae	カモシカ鈴鹿山地地域個体群 Capricornis crispus	0件	地域個体群 (LP)
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	シカ科 Cervidae	キュウシュウジカ甑島列島地域個体群 Cervus nippon	1件
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	シカ科 Cervidae	ニホンジカ馬毛島地域個体群 Cervus nippon	1件	地域個体群 (LP)

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