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上位分類群	目名	科名	和名／学名	指定都道府県数	環境省カテゴリ
菌類	トリコミケテス Trichomycetes	ハルペラ Hrpellales	ペンネラ・アングスティスポラ Pennella angustispora	1件
菌類	トリコミケテス Trichomycetes	ハルペラ Hrpellales	シムリオミケス・ミクロスポルス Simuliomyces microsporus	1件
菌類	トリコミケテス Trichomycetes	ハルペラ Hrpellales	オルフェラ・ハイシイ Orphella haysii	1件
菌類	接合菌 Zygomycetes	グロムス Glomerales	スクレロキスティス・コレミオイデス Sclerocystis coremioides	1件
菌類	接合菌 Zygomycetes	グロムス Glomerales	グロムス・ベルシフォルメ近縁種 Glomus cf. versiforme	1件
菌類	接合菌 Zygomycetes	トリモチカビ Zoopagales	トムライカビ Rhopalomyces strangulatus	1件
菌類	接合菌 Zygomycetes	ケカビ Mucorales	ドウタイクスダマカビ Cunninghamella homothallica	0件	野生絶滅 (EW)
菌類	接合菌 Zygomycetes	ケカビ Mucorales	スポロディニエラ・ウンベラータ Sporodiniella umbellata	1件
菌類	接合菌 Zygomycetes	ケカビ Mucorales	ジゴリンクス・ジャポニクス Zygorhynchus japonicus	1件
菌類	半子嚢菌 Hemiascomycetes	タフリナ Taphrinales	シイノキ類葉ぶくれ病菌 Taphrina kusanoi	0件	絶滅危惧Ⅰ類 (CR+EN)
菌類	半子嚢菌 Hemiascomycetes	プロトミケス Protomycetales	タンポポ浮腫病菌 Protomyces pachydermus	0件	絶滅危惧Ⅰ類 (CR+EN)
菌類	小房子嚢菌 Loculoascomycetes	ミクロチリウム－	ヒダカエア・ツミデュラ Hidakaea tumidula	1件
菌類	小房子嚢菌 Loculoascomycetes	ヒステリウム Hysteriales	グロニウム・サシコラ Glonium sasicola	1件
菌類	小房子嚢菌 Loculoascomycetes	アステリナ－	ルイハンチク Phragmothyrium semiarundinariae	1件
菌類	小房子嚢菌 Loculoascomycetes	アステリナ－	ヒュウガハンチクキン Asterinella hiugensis	1件	絶滅危惧Ⅰ類 (CR+EN)
菌類	核菌 Pyrenomycetes	クロサイワイタケ Xylariales	ホオズキタケ Entonaema splendens	1件
菌類	核菌 Pyrenomycetes	クロサイワイタケ Xylariales	ブナノホソツクシタケ Xylaria carpophila	2件
菌類	核菌 Pyrenomycetes	クロサイワイタケ Xylariales	フデタケ Xylaria apiculata	1件
菌類	核菌 Pyrenomycetes	クロサイワイタケ Xylariales	ハチスタケ Podosordaria jugoyasan	2件
菌類	核菌 Pyrenomycetes	ビンタマカビ－	ビンタマカビ Corynelia uberata	0件	絶滅危惧Ⅰ類 (CR+EN)

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