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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
哺乳類	ウシ目（偶蹄目） Artiodactyla	シカ科 Cervidae	ホンシュウジカ Cervus nippon centralis	佐賀	絶滅種
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	クマ科 Ursidae	ツキノワグマ Ursus thibetanus japonicus	熊本	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	熊本	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	熊本	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	クマ科 Ursidae	ツキノワグマ Ursus thibetanus japonicus	大分	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	大分	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	大分	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	クマ科 Ursidae	ツキノワグマ Ursus thibetanus japonicus	宮崎	絶滅 (EX-r,g,d)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	宮崎	絶滅 (EX-r,g,d)	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	クマ科 Ursidae	ツキノワグマ Ursus thibetanus japonicus	鹿児島	絶滅
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	鹿児島	絶滅	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	鹿児島	絶滅	絶滅 (EX)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	オオコウモリ科 Pteropodidae	オキナワオオコウモリ Pteropus loochoensis	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
哺乳類	コウモリ目（翼手目） Chiroptera	キクガシラコウモリ科 Rhinolophidae	ミヤココキクガシラコウモリ Rhinolophus pumilus miyakonis	沖縄	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	京都	絶滅種	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	京都	絶滅種	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	兵庫	絶滅	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	奈良	絶滅種	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	奈良	絶滅種	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	和歌山	絶滅 (EX)	絶滅 (EX)

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