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| 上位分類群 | 目名 | 科名 | 和名／学名 | 都道府県 | 文献上のカテゴリ | 環境省カテゴリ |
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| 無脊椎動物 | アマオブネガイ Neritimorpha |
ヤマキサゴ Helicinidae |
アカビシヤマキサゴ Ogasawarana rex |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | 盤足 Discopoda |
カワザンショウガイ Assimineidae |
リュウキュウカワザンショウ Assiminea sp. D |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
ヒラクボエンザガイ Hirasea diplomphalus latispira |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
コシタカエンザガイ Hirasea eutheca |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
ソコカドエンザガイ Hirasea goniobasis |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
ツヤエンザガイ Hirasea hypolia |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
オオエンザガイ Hirasea major |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
ハタイエンザガイ Hirasea nesiotica liobasis |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
ナカクボエンザガイ Hirasea planulata biconcava |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
ヒラマキエンザガイ Hirasea planulata planulata |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
コダマエンザガイ Hirasea profundispira |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
エンザガイ Hirasea sinuosa |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
エンザガイ Endodontidae |
エンザガイモドキ Hirasiella clara |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
ベッコウマイマイ Helicarionidae |
アツクチハハジマヒメベッコウ Lamprocystis hahajimana pachychilus |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
ベッコウマイマイ Helicarionidae |
オガサワラキビ Trochochlamys ogasawarana |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
ベッコウマイマイ Helicarionidae |
チチジマレンズガイ Vitrinula chichijimana |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | マイマイ Stylommatophora |
ベッコウマイマイ Helicarionidae |
ハハジマレンズガイ Vitrinula hahajimana |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 無脊椎動物 | ダニ Acarina |
ナミウモウダニ Pterolichidae |
トキウモウダニ Compressalges nipponiae |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 維管束植物 | シダ植物 PTERIDOPHYTA |
ヒカゲノカズラ Lycopodiaceae |
コウヨウザンカズラ Huperzia cunninghamioides |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
| 維管束植物 | シダ植物 PTERIDOPHYTA |
ハナヤスリ Ophioglossaceae |
タカネハナワラビ Botrychium boreale |
環境省 | 絶滅 (EX) | 絶滅 (EX) |
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