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上位分類群	目名	科名	和名／学名	都道府県	文献上のカテゴリ	環境省カテゴリ
維管束植物	離弁花類 ARCHICHLAMYDAE	モウセンゴケ Droseraceae	ムジナモ Aldrovanda vesiculosa	群馬	野生絶滅 (EW)	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus	奈良	野生絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イヌ科 Canidae	ニホンオオカミ Canis lupus hodophilax	滋賀	絶滅種	絶滅 (EX)
哺乳類	ネコ目（食肉目） Carnivora	イタチ科 Mustelidae	ニホンカワウソ本州以南亜種 Lutra lutra nippon	滋賀	絶滅種	絶滅 (EX)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	イタセンパラ Acheilognathus longipinnis	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
魚類	コイ Cypriniformes	コイ Cyprinidae	ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
昆虫類	トンボ ODONATA	アオイトトンボ Lestidae	コバネアオイトトンボ Lestes japonicus	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
昆虫類	トンボ ODONATA	トンボ Libellulidae	ベッコウトンボ Libellula angelina	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
昆虫類	カメムシ HEMIPTERA	コバンムシ Naucoridae	コバンムシ Ilyocoris cimicoides exclamationis	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	オサムシ Carabidae	キベリマルクビゴミムシ Nebria livida angulata	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	オサムシ Carabidae	オオヒョウタンゴミムシ Scarites sulcatus	滋賀	絶滅種	準絶滅危惧 (NT)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ゲンゴロウ Dytiscidae	スジゲンゴロウ Hydaticus satoi	滋賀	絶滅種	絶滅 (EX)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ゲンゴロウ Dytiscidae	シャープゲンゴロウモドキ Dytiscus sharpi sharpi	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ゲンゴロウ Dytiscidae	ゲンゴロウ Cybister japonicus	滋賀	絶滅種	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	コガネムシ Scarabaeidae	ダイコクコガネ Copris (Copris) ochus	滋賀	絶滅種	絶滅危惧Ⅱ類 (VU)
昆虫類	コウチュウ COLEOPTERA	ハムシ Chrysomelidae	キイロネクイハムシ Macroplea japana	滋賀	絶滅種	絶滅 (EX)
昆虫類	チョウ LEPIDOPTERA	シジミチョウ Lycaenidae	シルビアシジミ Zizina otis emelina	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠB類 (EN)
昆虫類	チョウ LEPIDOPTERA	タテハチョウ Nymphalidae	オオウラギンヒョウモン Fabriciana nerippe nerippe	滋賀	絶滅種	絶滅危惧ⅠA類 (CR)
維管束植物	合弁花類 SYMPETALAE	ハマウツボ Orobanchaceae	オオミコゴメグサ Euphrasia insignis ssp. insignis var. omiensis	滋賀	絶滅種	絶滅 (EX)
魚類	サケ Salmoniformes	サケ Salmonidae	クニマス Oncorhynchus kawamurae	環境省	野生絶滅 (EW)	野生絶滅 (EW)

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